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taxonomiste

taxonomiste

définition : taxonomiste

[[Fichier:Taxonomic hierarchy.svg|thumb|350px|La classification classique du vivant classe les êtres vivants selon une hiérarchie de groupes de plus en plus vastes.]]

La taxonomie, ou taxinomie, est une branche de la biologie, qui a pour objet de décrire les organismes vivants et de les regrouper en entités appelées taxons afin de les identifier puis les nommer et enfin les classer et de les reconnaitre via des clés de détermination dichotomiques. Elle complète la systématique qui est la science qui organise le classement des taxons et leurs relations. Parmi ces méthodes, les plus récentes incluent une nouvelle approche conceptuelle de la classification mais aussi des méthodes d'analyse d'éléments empiriques restés longtemps ignorés de la science avant l'arrivée, au cours de la seconde moitié du , des découvertes de la biologie moléculaire.

La s'étend maintenant à d'autres sciences, entre autres les sciences humaines et sociales, les sciences de l'information ou l'informatique.

== Étymologie et usage du mot ==

Le mot taxinomie provient du grec () « placement », « classement », « ordre » et de () qui signifie « loi », « règle »). Le terme fut créé en 1813, sous la graphie de taxonomie, par le botaniste suisse Augustin Pyrame de Candolle (1778-1841) dans sa Théorie élémentaire de la botanique ou exposition des principes de la classification naturelle et de l'art de décrire et d'étudier les végétaux, pour désigner dans sa « théorie des classifications » à la fois la méthode et ce qu'il a qualifié de « bases de la botanique philosophique » (Mémoires et souvenirs, Livre III, § 11). Dans la seconde édition publiée en 1819, il considérait la graphie du mot taxonomie incorrecte dans sa forme originale en mentionnant :

Le terme taxonomie est entériné en 1836 dans le Supplément au Dictionnaire de l'Académie française.

La graphie taxinomie était recommandée en 1864. Émile Littré, dans son Dictionnaire de la langue française (version 1872-1877) précisait que le mot taxinomie ou taxionomie pouvait aussi être utilisé, formé sur l'étymon grec taxis (l'ordre). Le Grand dictionnaire terminologique, au Québec, confirme que taxinomie est recommandé par plusieurs auteurs considérant « taxonomie » comme « un calque de l'anglais ' », ce qui est pourtant historiquement faux. En effet, ' n'apparait en anglais qu'en 1819 sous l'influence du français, soit six ans après qu'il a été inventé par De Candolle. Des dictionnaires français continuent cependant à répandre cette erreur que la graphie taxonomie (De Candolle, 1813) correspondrait à l'anglais '. Au contraire, la plupart des dictionnaires anglais affirment correctement que le mot ' dérive du français). Ainsi, la taxinomie n'est pas, étymologiquement, l'étude des taxons mais bien les lois sur l'ordre, donc les règles de la classification. Certains spécialistes font une différence dans l'usage, particulièrement en botanique, entre la taxinomie qui, formée sur l'étymon grec nómos (loi, règle), concerne les questions de classification, et la taxonomie qui, formée sur l'étymon grec ónoma (nom), se rapporte aux questions de nomenclature. D'autres savants font usage du terme taxionomie dans leur activité, particulièrement en zoologie, pour nommer les groupes d'êtres vivants. Cependant, le mot taxonomie est aussi et très souvent utilisé pour nommer la science de la description des taxons. Même les auteurs prônant l'usage du terme « taxinomie » ne parlent pas de « taxins » mais de taxons, à l'exception toutefois d'un spécialiste en entomologie invoquant la diffusion francophone des connaissances et déplorant l'influence de l'anglais. Les autres langues utilisent des termes similaires à « taxonomie », pas « taxinomie » ; ainsi, on écrit ' en allemand, ' en anglais, ' en espagnol (castillan), ' en portugais et en catalan, ' en italien, (') en russe, etc..

En 1957, en France, l'Académie des sciences adopte le nom de « Taxinomie » pour désigner la science de la classification.

Le terme est devenu d’usage courant au , soit dans la graphie originale, taxonomie, même si celle-ci est étymologiquement contestée voire considérée comme fautive, soit sous la graphie corrigée par Émile Littré, taxinomie avec un « i », même si celle-là est sciemment réfutée. Le remplacement du « o » par un « i » est perçu par certains comme du purisme, qui lui préfèrent le terme « taxonomie », en faisant valoir un usage majoritaire, la cohérence et un « principe de priorité ».

== Définition nomenclaturale == Le mot « taxonomie » est employé dans les appendices du Code international de nomenclature zoologique bilingue (publié en français et en anglais) en 1961 pour la première édition et en 1964 pour la deuxième édition.

Le texte en français de la troisième édition du Code international de nomenclature zoologique (1985) mentionne le terme « taxonomie ». Dans le glossaire, la « taxonomie » est définie comme étant « La théorie et la pratique de la classification des organismes ; partie de la systématique, l'étude des catégories d'organismes et de leur diversité ».

Le texte en français de la quatrième édition du Code international de nomenclature zoologique (1999) mentionne les deux termes « taxinomie » et « taxonomie ». Dans le glossaire, la « taxinomie ou taxonomie » est définie comme étant la « Théorie et pratique de la classification des organismes ».

== Différences entre taxinomie et systématique == Dans la plupart des disciplines de la biologie, le terme taxinomie est inséparable de celui de systématique, plus coopératifs et réactifs.
De plus, l'étude de la biodiversité bactérienne, ou des espèces du sol ou des océans, est complexe et nécessite - outre de nouveaux moyens - une collaboration entre de nombreux spécialistes répartis dans le monde entier.

Les naturalistes ont développé des outils de travail collaboratif et de partage avec par exemple Tela botanica (pour les botanistes) et plus récemment l'European Journal of Taxonomy (EJT ). C'est une revue scientifique internationale de taxinomie descriptive, soutenue par un Consortium EJT (de musées d’histoire naturelle et d'un jardin botanique), publiée en anglais, en format électronique, en licence Open Access, en licence Creative Commons (3.0), c'est-à-dire en accès libre, à publication gratuite et consultation gratuite. Elle traite des domaines de la zoologie, entomologie, botanique et paléontologie. Les articles sont des travaux originaux, devant répondre à des critères de haute qualité en termes de contenu scientifique et de forme (style, illustrations, etc.). La revue est européenne, mais les sujets peuvent concerner toutes les espèces, quel que soit leur pays d'origine. Les révisions taxonomiques, monographies et articles thématiques ou d'opinion pourront ainsi être mieux et plus rapidement partagés.

== Notes et références ==

== Voir aussi ==

=== Bibliographie === * * Classification phylogénétique du vivant, Guillaume Lecointre et Hervé Le Guyader, Belin * Gargominy O., Tercerie S., Daszkiewicz P., Régnier C., Ramage T., Dupont P. & Poncet L. (2012). Taxref V5.0, Référentiel Taxonomique Pour La France : Mise En Œuvre et Diffusion. Service du Patrimoine Naturel, Direction de la Recherche, de l’Expertise et de la Valorisation, Muséum national d'histoire naturelle, Paris, France, 75

=== Articles connexes ===

=== Liens externes === * [http://tolweb.org/tree/ Tree of Life Web Project], une classification visant à couvrir tout le vivant, aisée à parcourir (pas toujours mise à jour...) * [https://treebase.org/ TreeBASE], une base de données de publications sur la phylogénétique (très technique) * [http://www.tela-botanica.org/code Code international de nomenclature botanique de Saint-Louis] * [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=Taxonomy Base de données de Taxinomie : ''''] * [http://sfs.snv.jussieu.fr/resources/darlu_tassy.pdf Reconstruction phylogénétique] P. Darlu et P. Tassy (Fichier PDF gratuit à télécharger) * [http://www.funet.fi/pub/sci/bio/life/insecta/lepidoptera/ditrysia/noctuoidea/noctuidae/noctuinae/agrotis/index.html Exemple de site Internet en arborescence sur la taxinomie] * , Thomas Heitz, 2000. * [https://www.dailymotion.com/playlist/xo6mx_cinaps_effervesciences/video/x9z5o4_effervesciences-darwin-aujourdhui-y_tech Effervesciences (CINAPS Télévision) : Darwin aujourd'hui (avec Guillaume Lecointre)]

* Catégorie:Classification scientifique

Texte soumis à la licence CC-BY-SA. Source : Article https://fr.wikipedia.org/wiki/Taxonomie de Wikipédia

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